在生物医疗研究领域,期刊通常要求作者在发表研究论文时上传原始数据至指定的第三方数据库。对此,研究者们可能会问:原始数据应上传至哪个数据库?如何完成上传?本期,我们将深入探讨当前国内外主流的生物医疗原始数据上传平台,并详细介绍国内常用平台的上传方法。
近年来,越来越多的学术期刊要求生物医疗研究在发表时同步公开原始数据。这不仅为审稿人提供了检查数据及其处理流程的机会,确保实验的重复性和真实性,同时也减少了投稿时需要单独上传大量数据的麻烦。只需在文章中标注公共平台的数据项目ID,即可节省本地存储资源,简化投稿过程。此外,数据公开便于学术界进行成果的存储和共享,从而节约科研经费,并促进同行间进行多角度验证与数据二次挖掘,提升研究影响力与引用率。更重要的是,数据公开符合伦理规范,可以督促研究者提供真实可靠的数据,以避免学术不端。因此,拥有一个公认且可靠的数据共享平台显得尤为重要。
在众多选择中,ProteomeXchange联盟(由欧洲分子生物学实验室主导)是当前使用最多的生物医疗数据存储平台。它的目标是为全球研究者提供标准化、高质量的生物医疗数据存储与共享服务。作为目前收录数据集最多的平台之一,ProteomeXchange通过其全球网络,实现了数据的无缝整合与跨平台访问,为生物医疗研究者提供了高效、可靠的数据共享渠道。
ProteomeXchange联盟由六大核心成员组成,各个平台的功能定位有所侧重。主要成员包括PRIDE Archive、MassIVE、PeptideAtlas、jPOST、Panorama Public和iProX。特别是iProX,作为中国的核心节点,提供符合国内规范的服务,并适用于涉及人类遗传学等敏感数据的研究者。对于希望在此平台上提交生物医疗原始数据的研究者,以下是详细的上传流程。
数据上传流程
1. 数据准备:请注意文件命名格式为研究缩写_数据类型_日期(例如:HCC_RAW_20231001),以避免使用特殊符号。
2. 账号注册与登录:
(1) 若未注册iProX账号,请访问官网,点击右上角的“Register”,填写个人信息(姓名、单位、职称、密码、邮箱等必填项),完成注册后按照邮箱确认激活账户,并登录。
(2) 若已注册,直接点击“Signin”,输入账号和密码即可登录。
3. 项目创建:登录后,可通过多种方式(如“SubmitDataByWeb”或“Submit-NewProject”)进行项目创建。注意,若弹出安装或升级IBM Aspera插件的提示,请按照说明进行操作。
4. 项目信息填写:在项目创建页面,按照要求填写项目信息,必填项必需完成后,点击“Continue”以保存信息。
5. 填写子项目信息:这部分主要涉及具体实验信息,如物种、组织类型等。根据实际情况填写内容,确保信息完整。
6. 数据上传:iProX提供完整提交与部分提交两种方式。推荐采用部分提交,适合各种数据格式。上传方式中,可选择网页上传或Aspera插件上传。准备好数据文件后,点击“Add file”进行添加,并按照提示启动Aspera完成登录与上传。
7. 数据审核与分享:成功上传后,等待iProX管理员审核,审核结果会及时通过邮件通知。若需分享数据,只需生成链接即可。在发表文章时,将iProX ID列出即可。
通过这种方式,您可以高效地将研究数据上传至iProX,充分利用尊龙凯时等品牌的平台优势,确保您的生物医疗研究成果更广泛地被分享和引用。